病毒及噬菌体多样性发现

病毒及噬菌体多样性发现

生物体中的微生物对宿主的生理生化许多方面都有着重要的作用。在这些微生物中,病毒数量约为细菌数量的10倍,病毒以其庞大的数量和丰富的遗传多样性,以及与宿主之间的相互作用,在生物圈中发挥着不可替代的作用。
病毒分布于水体、冰川、土壤、动植物、微生物甚至某些病毒当中。近年来,人们在人体、土壤、冰川、海洋、各种动植物中都得到了大量的病毒组数据,发现了众多未知病毒,病毒组成为了微生物研究的“未知新世界”。
噬菌体作为细菌的天敌,是一种专门感染细菌的病毒,曾在上个世纪前叶短暂用于细菌感染的治疗。噬菌体广泛存在于自然环境中,我们周围和体内的噬菌体种类丰富,数量繁多,据估计地球上噬菌体的数量在1031-1032。如此丰富的噬菌体资源为我们提供了天然的精准杀菌的来源,可能会在应对全球抗生素耐药危机中发挥重要的作用。

基因帮病毒组学产品与服务为病毒及噬菌体多样性研究提供了强大的工具支持,用病毒组学技术有助于发现难培养、低丰度及常规技术难以发现的病毒及噬菌体。

看看科学家们如何使用病毒组学技术发现病毒及噬菌体的多样性

01

人体病毒及噬菌体的发现:

四川大学张曜耀与范振兴团队利用病毒组学技术,发现了胎儿肠道中存在丰富多样的微生物群,包括细菌、古菌和病毒及噬菌体,为早期胎儿免疫相关的研究提供了支持。

Liu X, He G, Lan Y, Guo W, Liu X, Li J, Liu A, He M, Liu X, Fan Z and Zhang Y. Virome and metagenomic analysis reveal the distinct distribution of microbiota in human fetal gut during gestation. Front Immunol . 2023 Jan 5;13:1079294.

02

动物病毒及多样性发现:

南京农业大学粟硕教授团队与中山大学医学院施莽教授团队对中国20个省份的1941只“野味”动物展开了大规模系统的病毒组调查,发现了65种之前从未被报道过的新病毒,这些病毒的多样性覆盖13个病毒科。

He WT, Hou X, Zhao J, Sun J, He H, Si W, Wang J, Jiang Z, Yan Z, Xing G, Lu M, Suchard MA, Ji X, Gong W, He B, Li J, Lemey P, Guo D, Tu C, Holmes EC, Shi M, Su S. Virome characterization of game animals in China reveals a spectrum of emerging pathogens.Ce

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海洋病毒及噬菌体多样性的发现:

美国俄亥俄州立大学Matthew B. Sullivan团队大量采集全球海洋样本进行病毒组学测序,分析了28TB 海洋RNA病毒组数据,以扩展地球的RNA病毒目录及其分类,调查它们的进化起源,并评估它们从极到极的海洋生物地理学。

Zayed AA, Wainaina JM,  et al.  Cryptic and abundant marine viruses at the evolutionary origins of Earth's RNA virome. Science . 2022 Apr 8;376(6589):156-162.

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