利用Meta Hi-C辅助噬菌体或者病毒的全基因组组装
利用Meta Hi-C辅助噬菌体或者病毒的全基因组组装
随着病毒组与宏基因组测序技术的发展,直接从微生物群落中研究病毒变得可能,病毒序列组装和病毒注释方面也取得了许多进展,病毒序列数据库快速扩展。虽然长读长测序技术一直在发展,但从宏基因组组装完整的病毒基因组仍然是一个主要挑战,因为微生物群落中大部分病毒的丰度较低,以及它们的快速突变率和随后在其序列中的高异质性,使得重建全长病毒基因组变得更加困难。
基因帮Meta Hi-C产品结合宏基因组分箱分析方法在重建病毒宏基因组组装基因组(vMAGs)方面具备出特别的优势,使用Hi-C数据将病毒重叠群与其微生物宿主基因组一起分箱,从而可以更好的组装出高质量的病毒基因组。