病毒颗粒富集技术

病毒颗粒富集技术

病毒组研究面临的最大问题在于如何尽可能降低宿主和其他微生物(主要是细菌)的核酸污染,同时尽可能保证病毒组的完整性。因此,病毒颗粒(Virus-like particles, VLPs)的富集是病毒组测序中至关重要的步骤。通常有两种方式来实现:一种是直接富集病毒样颗粒,如超速离心和密度梯度离心,这类技术因操作繁琐,需要超速离心机且通量低,目前在病毒组研究中已很少使用;第二种是通过去除宿主及细菌核酸污染富集病毒颗粒,常用方法包括利用病毒颗粒与宿主和细菌的不同直径大小或/和不同离心沉降速度等特征去除宿主细胞和细菌,用DNA酶消化无病毒颗粒保护的DNA等,此后根据不同样本的情况选择不同的富集方法,包括大分子聚合物沉淀病毒颗粒、超滤浓缩和综合多种富集手段等。
经过几年来不同项目的经验积累,我们对不同类型的样品进行了不同的实验优化处理,确保最大程度富集病毒核酸,降低宿主和细菌核酸的影响。此外,对于特殊样品,我们还可以提供个性化的优化实验,确保获得可靠有效的病毒组数据。

病毒颗粒富集技术流程图

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