细菌富集技术

在宏基因组测序数据中，部分组织和体液等样品因宿主占比极高（高达99%以上），微生物来源的reads占比极低，因而导致无法组装出有效的微生物DNA片段。因此，对于此类样品，有必要进行去宿主处理以富集微生物（主要是细菌）核酸后再建库测序。

目前宏基因组去宿主的方法主要包括两大类：第一类是通过选择性裂解宿主细胞并用核酸酶或苯甲酸酶等消化胞外DNA降解宿主核酸，然后再进行微生物核酸的提取；第二大类是进行宏基因组核酸提取后利用真核DNA甲基化修饰的特征特异地去除宿主DNA来富集细菌核酸。

我们所采用的方法是通过特异地裂解宿主细胞并酶解宿主核酸的方法进行去宿主处理，实测数据显示组织样品经去宿主处理后，宿主reads占比可以从95%以上降低到40-70%左右，检测到的微生物种类显著增加。如此，对于宏基因组数据的组装效果有极大的提升，能够满足后续的宏基因组分析需求。