真菌富集技术

自然界中的真菌种类和数量远远少于细菌，为了对宏基因组样品中的真菌进行更全面的研究和认识，我们需要对样品中的真菌进行富集。常规的真菌富集方法主要是通过对ITS区域的PCR扩增，其缺点在于只能通过对ITS区的分析获得真菌物种分类信息，无法获得真菌基因组其他区域的序列。而我们的真菌富集技术主要通过对宿主和细菌DNA的去除来实现，即在宿主和细菌DNA去除处理之后再进行真菌DNA提取，同时优化对于真菌的裂解，以提高真菌DNA的产量。由此获得的数据中，真菌基因组DNA的占比显著提高，从0.01-0.2%提高至18-45%，能够获得较好的真菌基因组组装结果，既能够对真菌组进行物种分类和多样性的分析，同时可以对真菌基因和功能以及与其他微生物的互作等进行更全面的分析。