游离DNA

游离DNA(Circulating free DNA or Cell free DNA,cfDNA)是指凋亡或坏死细胞释放到循环血液中的降解DNA片段,因为染色质被酶解后形成的DNA片段半衰期非常短(通常半小时以内),而其中核小体固定的DNA片段半衰期相对较长,因此检测到的cfDNA主要是以核小体形式存在,其片段分布主要集中于170bp左右。分离得到的cfDNA除了可以检测到凋亡坏死细胞释放到血液中的DNA,近年来也用于外源性DNA与RNA的检测,如真菌血症、细菌血症和病毒血症等病理情形下的血中外源核酸。

cfDNA测序分析
产品介绍
应用方向
案例解析
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cfDNA测序分析 是指将血液中游离的DNA分离提取出来,构建小片段文库,利用二代测序的方法进行测序,然后用生物信息学工具进行分析,从而基于cfDNA的信息开展疾病的诊断、预后、监测等方面的研究。

技术流程

样本处理
cfDNA提取
构建文库
高通量测序
生物信息分析

分析流程

基础数据处理

数据质控

去除低质量及接头序列

标准分析

参考基因组同源性比较

cfDNA片段分布统计

cfDNA丰度分析

cfDNA来源分析

cfDNA组间差异分析

cfDNA突变分析

个性化分析

根据研究需要定制分析内容

交付标准

数据

10G raw data

分析

根据客户的需求提供标准分析和定制化分析

周期

测序版:30个工作日

标准版:50个工作日

其他标准根据样本情况确定

样品要求

如果采用EDTA抗凝管采血,请按以下步骤分离血浆,并提供2ml以上血浆样品:

(1) 用EDTA抗凝管采集5-10 ml血液,充分混匀,室温静置5min左右放4℃冰箱保存,尽量在2h内完成血浆分离;

(2) 将采血管置于4℃冷冻离心机中,1600g离心10min;

(3) 小心吸取上清至1.5ml 或2mlEP管中,避免吸入血细胞,置于4℃冷冻离心机中16,000g离心10min;

(4) 小心吸取上清至冻存管,-80℃保存。

如果不具备及时进行低温离心处理的条件,则需采用cfDNA专用采血管保存全血及运输,详细操作步骤及注意事项请参考所购买的cfDNA专用采血管操作说明。