Hi-C

Hi-C 全称为高通量染色体构象捕获技术,其主要是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱,更加全面阐述染色质三维结构。

Meta Hi-C 测序分析
产品介绍
应用方向
案例解析
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Meta Hi-C测序分析产品是将Hi-C技术与宏基因组测序进行结合,基于Hi-C的技术原理,对样本中的所有微生物进行固定交联、酶切消化、邻近DNA连接、捕获等处理获得空间上邻近的DNA片段,再进行宏基因组建库测序,继而通过生物信息学方法基于细胞内相互作用关系将同一微生物内的染色体、质粒和噬菌体等元件区分出来,进而可以辅助组装出完整基因组,绘制高分辨率的宿主、质粒与噬菌体的相互作用图谱。

技术流程

样本处理
交联固定
限制性酶切
Meta Hi-C建库
高通量测序
生物信息分析

分析流程

基础数据处理

数据质控

去除低质量及接头序列

去除宿主及污染序列

序列组装与鉴定

单样本组装,多样本聚类去除冗余

细菌、真菌、病毒序列注释

ORF预测与基因注释

物种多样性分析

序列及物种丰度计算

α、β多样性分析

差异分析

相关性分析

噬菌体与细菌相关性热图

噬菌体与细菌相关性网络图

功能分析

MetaHiC聚类、MetaHiC聚类结果注释和评估

质粒/整合子/噬菌体注释鉴定

抗性基因分布

交付标准

数据

10G raw data

分析

我们根据客户的需求提供不同的交付标准。

周期

测序版:40个工作日

标准版:60个工作日

其他标准根据样本情况确定

样品要求

人粪便:1g以上,每个样3-5管备用。

小鼠粪便:5粒,每个样3-5管备用。

土壤:不低于30g一管,每个样5-8管备用。